化学系肇始于1910年成立的京师大学堂格致科化学门，是国立大学中最早设立的化学系，1994年更名为化学与分子工程学院。其化学学科是国家一级重点学科，历次教育部全国高校一级学科评估均居榜首，全球高校化学院（系）相关排名前列。
化学学院以培养“具有健全人格、独立思辨能力和国际竞争力”的杰出人才为使命，致力于培养热爱祖国，崇尚科学，具有高度社会责任感和科学文化素养的化学及相关领域的引领型人才。同时秉承“立足基础、面向国家需求”传统，推动化学与材料、生命科学交叉，以新化工和AI化学为增长点，为国家高新产业、国防建设及医疗健康提供支撑，助力科学前沿与技术创新发展。
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